认证中心是经国家批准成立，依照国际认可导则认可并运行的质量认证机构，承担政府授权强制认证和客户委托的合格性认证工作。2008年，总院拥有全资的中联认证中心和中汽认证中心两家认证机构。
    核设备安全与可靠性中心是国家核安全局指定的核安全审评与监督技术（支持）单位。核设备监造中心负责积极开拓核电设备监造业务市场。
     2008年完成认证企业663家，发放证书1712张；累计完成认证企业6488家，发放证书11635张。

     产品质量监督检测中心是政府批准、依照国际实验室导则认可并开展工作的产品检验机构，承担政府授权质量检查和客户委托的产品检测任务。国家和行业设于院内的产品质量监督检测中心13个，其中国家级质检中心4个、行业级质检中心9个。